Президент указында әйтелүенчә, байрак — Федераль таможня хезмәтенең рәсми символы һәм реликвиясе — таможня органнарының традицияләрен чагылдыра. Ул — чит-читләре ак каймалы туры өчпочмаклы яшел төсле тукыма. Периметрында - үрелгән алтынсу орнамент.
Үзәктә канатларын күтәргән таҗлы ике башлы алтын бөркет урнаштырылган. Байракның икенче ягында Федераль таможня хезмәтенең эмблемасы: ике башлы алтын бөркетне астан яртылаш каплап торган дүртпочмаклы яшел геральдик калкан сүрәтләнгән. Калканда бер-берсе белән кисешкән факел белән махсус тимер таяк (жезл) тора.
Киңкүләм мәгълүмат чараларыннан Ләйсән Вәлиуллина хәзерләде.